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trilink基因編輯

更新時(shí)間:2020-08-11      點(diǎn)擊次數(shù):1473

trilink基因編輯

基因組編輯已成為治療發(fā)展中令人興奮的新領(lǐng)域之一。存在多種用于基因組編輯的工具。簇狀規(guī)則間隔的短回文重復(fù)序列(CRISPR)/ Cas9由于其高效和易用性,已成為受歡迎的基因組編輯工具。Cas9 mRNA與指導(dǎo)RNA的共轉(zhuǎn)染導(dǎo)致雙鏈斷裂,可以通過非同源末端連接(NHEJ)修復(fù),從而導(dǎo)致使目標(biāo)基因失活的插入缺失。如果與切割位點(diǎn)具有同源性的供體DNA模板也被共轉(zhuǎn)染,則同源性指導(dǎo)的修復(fù)可導(dǎo)致基因校正或插入。

TriLink提供了三種類型的Catalog mRNA,用于CRISPR基因組編輯。對于CRISPR / Cas9基因編輯,這些包括具有未修飾堿基的Cas9 mRNA以及經(jīng)5-甲氧基尿苷修飾以減少先天免疫應(yīng)答的Cas9 mRNA。我們還提供經(jīng)5-甲氧基尿苷修飾的Cas9切口酶。Cas9切口酶具有D10A氨基酸突變,可防止DNA鏈之一的切割。結(jié)果,Cas9切口酶產(chǎn)生單鏈切口,而不是雙鏈斷裂。DNA的切割或編輯通過約100個核苷酸的單個引導(dǎo)鏈RNA(sgRNA)定向到特定的染色體位置。CRISPR的另一種核酸酶是Cas12a。CRISPR / Cas12a基因編輯使用約42個核苷酸的RNA導(dǎo)鏈。TriLink提供未修飾的Cas12a或5-甲氧基尿苷修飾的Cas12a mRNA。 

我們的基因編輯工具中包括Cre重組酶,這是一種酪氨酸重組酶,可催化兩個loxP位點(diǎn)之間的重組。由于Cre介導(dǎo)的重組,兩個都包含loxP位點(diǎn)的獨(dú)立DNA物種可能發(fā)生融合事件。Cre可用于將DNA序列插入包含loxP位點(diǎn)的基因組。它也可用于細(xì)胞標(biāo)記研究,其中Cre表達(dá)激活了轉(zhuǎn)基因小鼠品系中l(wèi)oxP位點(diǎn)側(cè)翼的無活性報(bào)告基因。然后,用Cre mRNA轉(zhuǎn)染的細(xì)胞將表達(dá)報(bào)告基因,并揭示哪些細(xì)胞被高效轉(zhuǎn)染。

 

成簇的規(guī)則間隔的短回文重復(fù)序列(CRISPR)迅速成為基因組編輯領(lǐng)域受歡迎的工具。CRISPR已被適配用于細(xì)菌抗噬菌體免疫系統(tǒng)的哺乳動物細(xì)胞。

TriLink CRISPR工具套件包括兩個組件:個是由Cas9或Cas12a mRNA編碼的CRISPR核酸酶,第二個是向?qū)NA。實(shí)際上,Cas9指南由CRISPR RNA(crRNA)和反式CRISPR RNA(tracrRNA)組成。為了簡化和提高效力,研究人員將這兩個RNA融合為一個約100個核苷酸的單個RNA,他們將其稱為單個向?qū)NA(sgRNA)。與Cas9相比,Cas12a使用約42個核苷酸的單個引導(dǎo)RNA。

當(dāng)將Cas9或Cas12a mRNA和sgRNA共轉(zhuǎn)染到細(xì)胞中時(shí),引導(dǎo)鏈將Cas9或Cas12a蛋白導(dǎo)向基因組中的特定位置,然后在Cas9中產(chǎn)生雙鏈斷裂。Cas9切口酶mRNA編碼具有D10A突變的Cas9,該突變導(dǎo)致單鏈切口而不是雙鏈斷裂。這可能導(dǎo)致較少的脫靶效應(yīng)。

嵌合抗原受體(CAR)T細(xì)胞已被用作血液腫瘤臨床治療的過繼性T細(xì)胞療法(ACT)免疫療法之一。近,它們也已經(jīng)應(yīng)用于實(shí)體瘤。

通常對CAR構(gòu)建體進(jìn)行修飾,使其包含單鏈抗體片段(scFv)結(jié)合結(jié)構(gòu)域,跨膜結(jié)構(gòu)域,以及通過獨(dú)立于主要組織相容性復(fù)合物(MHC)的細(xì)胞內(nèi)信號傳導(dǎo)域激活T細(xì)胞的能力。修飾的T細(xì)胞在細(xì)胞表面表達(dá)CAR,其在治療期間識別腫瘤相關(guān)抗原。

從要治療的患者中收集大多數(shù)CAR T細(xì)胞的原始材料(自體移植)。擴(kuò)增并修飾收獲的細(xì)胞以表達(dá)CAR。CRISPR通常用于在TRAC(T細(xì)胞受體α常數(shù))位點(diǎn)特異性插入位點(diǎn),取代內(nèi)源性T細(xì)胞受體。自體移植可避免排斥反應(yīng)和移植物抗宿主病,但這些細(xì)胞通常來自病情較重的患者,因此效力可能不及健康供體所收集的細(xì)胞。另一種通用的現(xiàn)成解決方案是使用來自健康,同種異體供體的修飾細(xì)胞。這提供了一種途徑來克服高昂的成本,一定程度地減少制造復(fù)雜性,縮短治療時(shí)間并解決患者健康和生物安全問題。

然而,為了防止這些外源細(xì)胞的排斥,需要通過CRISPR進(jìn)行廣泛的基因缺失。CRISPR-Cas工程提供了下一代CAR T細(xì)胞解決方案,可以沉默或破壞任何所需的基因組基因座,使移植物抗宿主?。℅vHD)和排斥反應(yīng)小化,敲除檢查點(diǎn)受體,增強(qiáng)抗腫瘤反應(yīng)等。今天的CRISPR-Cas工程CAR T細(xì)胞在治療感染性疾病,自身免疫性疾病和提高移植耐受性方面具有治療潛力。

TriLink為CRISPR提供了幾種未經(jīng)修飾或經(jīng)5-甲氧基尿苷(5moU)修飾的mRNA,以減少先天免疫應(yīng)答。在該領(lǐng)域*的研究人員的幫助下,這些序列已進(jìn)行了序列優(yōu)化,以實(shí)現(xiàn)良好表達(dá)。TriLink還生產(chǎn)鋅指核酸酶和轉(zhuǎn)錄激活因子樣效應(yīng)子核酸酶(TALEN)mRNA,用于生產(chǎn)CAR T細(xì)胞療法。當(dāng)您準(zhǔn)備將研究成果轉(zhuǎn)移到臨床時(shí),TriLink會在我們的cGMP設(shè)施中提供GMP合成的導(dǎo)鏈和核酸酶mRNA。

 

重組酶

位點(diǎn)特異性重組酶是用于操縱基因組以及有條件地激活或去激活細(xì)胞和生物體中基因表達(dá)的有用工具。重組酶識別約30-40個核苷酸的短目標(biāo)DNA序列,并催化定向DNA交換反應(yīng)。由于識別位點(diǎn)在高等生物的基因組中并不常見,因此可以用作工程改造基因組的工具。然而,重組酶在細(xì)胞或體內(nèi)的持續(xù)表達(dá)可能會導(dǎo)致毒性和不合需要的脫靶重組。因此,mRNA的瞬時(shí)表達(dá)是重組酶表達(dá)的理想方法。

常用的重組酶之一是Cre重組酶。我們CleanCap ® NLS-Cre重組酶基因是一個上限(第1章)和聚腺苷酸化信使RNA,編碼Cre重組酶融合到核定位序列(NLS)。Cre重組酶是衍生自P1噬菌體的酪氨酸重組酶。Cre催化兩個loxP位點(diǎn)之間的重組,這些位點(diǎn)由一個34個堿基對的識別位點(diǎn)(5'ATAACTTCGTATAGCATACATTATACGAAGTTAT 3')組成。Cre重組酶已被廣泛用于操縱植物,細(xì)菌,酵母和哺乳動物中的DNA。根據(jù)loxP位點(diǎn)的方向,Cre可用于誘導(dǎo)DNA盒交換,切除/插入,倒位和易位。

NLS-Cre重組酶mRNA的應(yīng)用包括創(chuàng)建敲除或敲入動物,組織特異性蛋白表達(dá)以及標(biāo)記研究,這些研究報(bào)道了將mRNA遞送至給定細(xì)胞類型。Cre重組酶mRNA也是評估體外體內(nèi) mRNA遞送效力的有用工具

 

 

人才

轉(zhuǎn)錄激活因子樣效應(yīng)核酸酶(TALENs)已經(jīng)成為鋅指核酸酶(ZFN)的一種更容易獲得的替代物。像ZFN一樣,TALENs利用模塊化的DNA結(jié)合基序,可以對其進(jìn)行修飾以引入新的DNA結(jié)合特異性。與ZFN不同,TALEN不太容易使從頭設(shè)計(jì)復(fù)雜化的序列上下文效應(yīng),使它們成為普通科學(xué)界更實(shí)用的工具。TriLink自定義mRNA轉(zhuǎn)錄服務(wù)包括TALEN mRNA。TALEN由多個重復(fù)可變雙殘基(RVD)組成,每個重復(fù)殘基與單個核苷酸結(jié)合。通過以特定順序?qū)VD串在一起制成TALEN陣列,以提供對新型DNA序列的特異性和結(jié)合親和力。通常,工程化的TALEN序列與非特異性切割結(jié)構(gòu)域融合,例如FokI。與ZFN一樣,TALEN充當(dāng)與相鄰DNA序列結(jié)合的對。TriLink提供了mRNA表達(dá)載體,旨在輕松接受使用Golden Gate方法克隆的TALEN。

 

 

轉(zhuǎn)座酶

轉(zhuǎn)座酶是一種以非常準(zhǔn)的方式催化轉(zhuǎn)座子(DNA元件)從基因組中的一個位置移動到另一位置的酶。轉(zhuǎn)座子廣泛存在于人類基因組中,并可能導(dǎo)致多達(dá)40%的基因組重排。轉(zhuǎn)座酶是將外源序列插入靶基因組的早可用工具之一。通常,用于轉(zhuǎn)移的序列在轉(zhuǎn)座子盒中側(cè)接反向末端重復(fù)序列。當(dāng)轉(zhuǎn)座子盒與轉(zhuǎn)座酶mRNA共轉(zhuǎn)染時(shí),轉(zhuǎn)座酶催化轉(zhuǎn)座子的切除及其插入細(xì)胞染色體中。兩種常見的轉(zhuǎn)座酶/轉(zhuǎn)座子系統(tǒng)是Sleeping Beauty和PiggyBac。睡美人轉(zhuǎn)座子整合到基因組的TA序列中,

 

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